如治療及時，病損可完全消失而無損害，但附睪功能仍可能受到一定影響。如治療不及時或治療不當，炎癥可發展形成膿腫，導致附睪組織的嚴重損害。此外，附睪炎可繼發纖維化，導致附睪管道的狹窄或閉塞。雙側附睪損害常可導致男子不育癥或男子生育力低下。在睪丸被累及的情況下，還可引起睪丸生精功能障礙。附睪膿腫可延伸并破壞睪丸（附睪睪丸炎）。急性附睪炎可演變為慢性附睪炎。
