-膜蛋白具有多種功能,在細胞識別、細胞信號轉導、運輸等有著中著重要的角色,因此也是ji佳的藥物靶點。抽提膜蛋白主要是進行蛋白組分析:常用的實驗是非變性膠電泳、酶活分析、SDS-PAGE、western blot等。本文敘述了總蛋白的抽提方法、和膜蛋白的提取方法。
一、從新鮮樣品中提取總蛋白(簡易法)
1. 自配裂解液(pH 8.5-9.0):50 mM Tris-HCl,2 mM EDTA , 100 mM NaCl,0.5% Triton X-100,調pH值至8.5-9.0備用;用前加入100 μg/ml 溶菌酶,1 μl/ml 的蛋白酶抑制劑PMSF。該裂解液用量為10-50 ml 裂解液/1 g濕菌體。
2. 將40 ml 菌液在12000 g,4 ℃下離心15分鐘收集菌體,沉淀用PBS懸浮洗滌2遍,沉淀加入1 ml裂解液懸浮菌體。
3. 超聲粉碎,采用300 w,10 s超聲/10 s間隔,超聲20 min,反復凍融超聲3次至菌液變清或者變色。
4. 1000 g離心去掉大碎片,上清可直接變性后PAGE電泳檢測,或者用1% SDS溶液透析后凍存。
缺點:Western blotting結果表明,疏水性跨膜蛋白提取效率有限。
二、從Trizol裂解液中分離總蛋白
1. Trizol溶解的樣品研磨破碎后,加lv仿分層,2-8 ℃下10000 g離心15 min,上層水相用于RNA提取,體積約為總體積的60%。
2. 用乙醇沉淀中間層和有機相中的DNA。每使用1 ml Trizol加入0.3 ml無水乙醇混勻,室溫放置3 min,2-8 ℃不超過2000 g離心5 min。
3. 將上清移至新的EP管中,用異丙醇沉淀蛋白質。每使用1 ml Trizol加入1.5 ml異丙醇,室溫放置10 min,2-8 ℃下12000 g離心10 min,棄上清。
4. 用含有0.3 M 鹽酸胍的95%乙醇洗滌。每1 ml Trizol加入2 ml洗液,室溫放置20 min, 2-8 ℃下7500 g離心5 min,棄上清,重復洗滌2次。蕞后加入2 ml無水乙醇,渦旋后室溫放置20 min,2-8 ℃下7500 g離心5 min,棄上清。
5. 冷凍干燥5-10 min,1%SDS溶液溶解,反復吹打,50 ℃溫浴使其完全溶解,2-8 ℃下10000 g離心10 min去除不溶物。
6. 替代方案:將3中的酚醇上清液移至小分子量透析袋中,在2-8 ℃的1% SDS溶液中透析3次,1000 g離心10 min去除沉淀,上清可直接用于蛋白實驗。
三、從新鮮樣品中提取疏水性膜蛋白(Triton X-114去污劑法)
1. 配制疏水性蛋白提取液(非裂解液):1% Triton X-114,150 mM NaCl, 10 mM Tris-HCl,1 mM EDTA,調pH值至8.0備用。
2. 菌液于4 ℃條件下15000 g離心15 min收集菌體;用1 ml 含有5 mM MgCl2 的PBS洗滌3次,蕞后于4 ℃條件下15000 g離心15 min收集菌體。
3. 菌體沉淀加入1 ml冷提取液,于4 ℃條件下放置2 h,17000 g離心10 min,去除沉淀取上清。
4. 將上述上清中的Triton X-114含量增加到2%,再加入20 mM的CaCl2抑制部分蛋白酶活性,37 ℃條件下放置10 min使其分層。室溫下1000 g離心10 min使液相和去污相充分分層。
5. 將液相和去污相分開,分別用10倍體積的冷丙酮在冰上沉淀45 min。
6. 于4 ℃條件下17000 g離心30 min,用去離子水洗滌沉淀3次。
7. 將沉淀溶解在1% SDS溶液中,測定蛋白濃度,比較液相和去污相中蛋白提取效率,一般是去污相中疏水性膜蛋白較多,適于進一步蛋白實驗。
8. SDS-PAGE進一步分析液相和去污相的蛋白圖譜。
美國梅奧診所團隊在新一期《臨床研究雜志》發表報告稱,癌細胞會借助一種名為TRAILshort的蛋白,巧妙關閉人體的免疫反應。這一突破有望催生全新的癌癥療法,或提升現有免疫療法的效力。約15年前,團隊在......
在人類中,活到百歲已是長壽,而在鯨類中,這個歲數還算“年輕”,因為該家族中的弓頭鯨有時能活200多年。但沒人知道弓頭鯨長壽的原因。一項10月29日發表于《自然》的研究發現,弓頭鯨能夠活數百年且不患癌癥......
美國加州大學舊金山分校科學家發現,大腦衰老背后隱藏著一種名為FTL1的關鍵蛋白。實驗顯示,過量FTL1蛋白會導致小鼠記憶力衰退、大腦神經連接減弱以及細胞反應遲鈍。一旦阻斷這種蛋白,老年小鼠就能恢復年輕......
中國科學院上海藥物研究所研究員羅成、周兵、陳奕和華東師范大學研究員陳示潔合作,提出“強支點占據-杠桿干擾”(FOLP)的蛋白-蛋白相互作用(PPI)先導化合物設計策略,為PPI領域研究提供新的概念和方......
水稻作為最重要的糧食作物,為超過半數的世界人口提供主食。然而,水稻黑條矮縮病毒(SRBSDV)等病毒嚴重危害水稻生長,威脅糧食生產安全,解析病毒—水稻互作的分子機制對水稻病毒病的防控具有重要意義。近日......
記者從安徽農業大學獲悉,該校王曉波教授團隊聯合中國農業科學院作物科學研究所邱麗娟、李英慧研究員團隊,解析了關鍵基因對大豆種子油脂和蛋白比例(油蛋比)的調控機制,為高油或高蛋白大豆品種選育提供了新方向。......
中國科學院院士施一公團隊解析了BAX線狀/環狀聚合物所共享的基本重復單元結構,解答了“死神”BAX究竟是如何讓細胞走上死亡命運的不歸路。6月27日,相關研究成果發表在《科學》。BAX多邊形結構。課題組......
澳大利亞沃爾特和伊麗莎霍爾醫學研究所團隊在對抗帕金森病的斗爭中取得重大突破:他們成功解開了一個長達數十年的謎團,確定了人類PINK1蛋白與線粒體結合的具體結構,為開發治療帕金森病的新藥開辟了新道路。這......
暨南大學生命科學技術學院教授鄒奕團隊在廣東省重點研發項目、廣東省自然科學基金等項目的資助下,研究發現轉甲狀腺激素蛋白或成術后認知功能障礙診斷新標志物,有望助力早期干預。近日,相關成果發表于《分子精神病......
過去幾年里,單細胞蛋白質組學技術取得了長足發展,單細胞蛋白質組學逐漸走向成熟,后續有望廣泛應用于腫瘤異質性分析、免疫學研究、發育生物學、神經科學以及精準醫學等領域。然而,從技術發展成熟到實際場景應用分......