此病多發生于女性，可在任何年齡發病。嬰兒常有持續性鵝口瘡。病變輕者僅累及指甲，重者全身皮膚、黏膜和毛發受累。皮膚有鱗屑、濕疹，黏膜有念珠菌粘著性白斑，指甲營養不良或角化過度。慢性食管念珠菌病可致食管狹窄，并可伴發鼻竇及肺部感染。患兒生長發育障礙，老年發病者一般較輕。
另一類型是少年家族性多內分泌綜合征伴念珠菌病，除有輕至中度念珠菌病外，一般在念珠菌發病后數年出現甲狀腺功能減退、甲狀旁腺功能減退、Addison病或糖尿病。通常可查到受累內分泌器官的自身抗體。此外，尚可并發卵巢功能障礙、惡性貧血、脫發和慢性活動性肝炎等。