主要是抗霉菌治療。口腔可用龍膽紫、制霉素和克霉唑；全身則用酮康唑和二性霉素B治療。
指甲霉菌感染可手術清除。用轉移因子進行免疫刺激，并聯合應用二性霉素B，可提高療效，減少藥物毒性。此外，還可采用胸腺上皮、胸腺激素或免疫淋巴細胞進行治療，亦可取得暫時療效。
