上海市公共衛生臨床中心教授盧洪洲、周曉輝傳染病醫學科研團隊,應用國際先進的單細胞轉錄組測序技術和單細胞染色質可及性分析技術,揭密了新冠患者體內T細胞特性和變化規律,他們剖析了入組的新冠重癥、危重患者,普通型患者和健康志愿者(共3組)的外周血T細胞的表觀遺傳特征和免疫轉錄圖譜,并對數據進行分析后發現,T細胞炎癥狀態和CD4+T細胞功能缺陷程度輕重是決定新冠患者重癥發病或能否恢復健康的關鍵因素。該研究對深入了解新冠病毒感染致病的免疫機制和指導新冠重癥患者的臨床救治有重要意義。該成果已刊登于《免疫學前沿》。
據悉,T細胞是抗病毒前線的指揮官和一線戰士,在人體與新冠病毒的斗爭中發揮著重要作用;抗病毒中和抗體如精準型導彈,可以防止病毒侵入人體細胞;而T細胞亞群中的CD4輔助性T細胞,是輔助抗體產生的關鍵角色, CD8+T細胞是殺傷性細胞,一旦發現體內有病毒就會直接撲上去殺傷并清除它們。臨床發現,老年新冠患者常發生T細胞的數量減少和功能減弱,與他們有更高的重癥化率和病死率有關聯,但其中T細胞功能變化的具體機制醫學界一直未搞清楚。
為搞清楚這一問題,盧洪洲、周曉輝科研團隊,首先對新冠重癥、危重患者,普通型患者和對照組健康志愿者的外周血單個核細胞進行了單細胞染色質可及性(9例)和轉錄組(15例)高分辨率深度測序。結果分別獲得了極有研究價值的76570和107862個單細胞的數據,然后進行“染色質”可及性和轉錄組分析,結果在三組中共檢測到28535個不同的“峰”,其中41.6%和10.7%分別位于基因組啟動子區和增強子區。
周曉輝說,人體基因均存儲于細胞核的染色質上,但平時染色質處于一種凝聚的不開放狀態。基因要實現表達,需在染色質上對應的特定區域打開,這樣,細胞的轉錄機器才能結合到相應DNA上實現基因表達。染色質的開放就是“染色質可及性”。對基因組上所有開放區域進行測序,即可測出一個“峰”值;而轉錄組測序則是對基因組轉錄出的所有信使RNA進行測序,可分析出新冠患者體內有多少基因被轉錄表達。
據盧洪洲介紹,以往傳統的測序分析,每個病人的樣本只能產生1套數據,而此次單細胞的高分辨率測序,可對每個病人每個樣本中的5000個以上的細胞分別進行精準測序,因此每個病人的樣本就可產生5000個以上的不同細胞的獨立數據,這樣就能更精細地揭示新冠患者細胞的基因表達和功能的關系。
研究結果表明,與健康人對照組相比,在新冠重癥和危重患者中,CD4+T細胞的關鍵基因的染色質可及性比普通型患者中的要低。此外,單細胞轉錄組測序顯示,與健康人對照組相比,新冠重癥和危重患者、普通型患者中的T細胞,特別是CD4+T細胞的比例降低,其中輔助性T細胞亦顯著減少。同時,研究數據提示, T細胞炎癥狀態伴隨CD4+T細胞功能缺陷程度重輕,是決定新冠患者重癥發病抑或能否恢復健康的關鍵因素。
專家表示,該研究為深入理解新冠病毒感染致病的免疫機制提供了一個全新的視角,對指導新冠重癥患者的臨床救治有重要參考價值。
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