手術治療的指征為：
(1)藥物治療失敗或因藥物嚴重不良反應不能耐受者。
(2)甲狀腺不能排除惡性者。
(3)甲狀腺腫大局部有壓迫癥狀(喉返神經，氣管)。
實際上妊娠期須施行甲狀腺部分切除者很少，如需手術最好在妊娠中期進行，術前應給予碘劑7～10天。手術并發癥與非孕期同，可有喉返神經損傷及甲狀旁腺功能減退(1%～2%)。早孕時手術治療流產發生率約8%。
