小兒甲狀腺癌多為分化型甲狀腺癌，手術是主要的治療方法。
（1）切除范圍目前對手術方式的選擇仍存在爭議，爭論的焦點集中在甲狀腺切除的范圍及頸淋巴清掃的范圍。
主張行甲狀腺全切除的依據是：
①甲狀腺全切除可以確保切除臨床上不明顯的多灶性病變，而多灶性甲狀腺癌的發生率可達40%；
②隨著手術技巧的不斷提高，甲狀腺全切術的并發癥的發生率已大大減少；
③便于術后應用放射性碘進行診斷性掃描，并治療微小的區域性或遠處轉移的甲狀腺癌病灶；
④便于術后測定血清TG，進行術后監測，以發現殘留或復發的病灶。
主張行甲狀腺次全切除的依據是：
①小兒甲狀腺癌的預后好，死亡率低，即使伴有遠處轉移，依然有很高的長期生存率，而手術并發癥是其主要的死亡原因；
②甲狀腺次全切除術后，對側甲狀腺葉發生甲狀腺癌的并不常見，即使甲狀腺癌復發也是非致命的，常規進行甲狀腺全切除并無必要；
③即使發生術后有對側甲狀腺葉的甲狀腺癌，仍可再次手術切除。
（2）手術原則
①病變位于甲狀腺的一側腺葉，必須行該側腺葉全葉切除，如果病變遠離甲狀腺峽部，則加峽部切除即可；如果病變靠近峽部，則加峽部和對側腺葉次全切除。
②病變位于甲狀腺峽部，則行雙葉次全切除+峽部切除，并清掃雙側6區淋巴結。
③甲狀腺的雙側葉內均有癌變結節，則應行全甲狀腺切除+雙側6區淋巴結。
④如果有遠處轉移，不論結節情況如何均應行全甲狀腺切除。
⑤對于未發現頸淋巴結轉移的患兒，只切除喉前淋巴結、氣管前淋巴結、氣管旁淋巴結（頸淋巴結第Ⅳ區）。
⑥對于頸淋巴結轉移的患兒應行功能性頸清掃（保留胸鎖乳突肌、頸內靜脈及副神經）；如雙側頸淋巴結均轉移，則行雙側功能性頸清掃。
⑦如果癌腫侵犯到頸內靜脈及鄰近肌肉神經，則應行標準頸清掃。