對于重度和多數中度糖尿病足感染患者，有必要請擅長這方面治療的外科醫生會診。感染并發膿腫、骨或關節的廣泛受累、出現捻發音、壞死、壞疽或壞死性筋膜炎時，需要外科手術清創治療，而且清創術對嚴重膿毒癥患者感染源的控制亦十分重要。早期外科清創的應用已在一項包含112例嚴重糖尿病足感染患者的回顧性研究中進行了闡述。就診時接受外科干預的患者，比術前接受為期3日的靜脈抗生素治療的患者，有明顯更低的踝關節以上截肢率。
除了外科清創術，還可能需要血管重建術(通過血管成形術或旁路移植術)和/或截肢。應根據血管評估來確定所需的手術范圍。