IC)：由于離子交換分離的洗脫液幾乎都是強電解質，其電導一般要較待測離子高二個數量級，簇會完全覆蓋了待測離子的信號。為提高檢測靈敏度，采用在分離柱后串聯抑制柱的辦法，可使洗脫液轉變成低電導組分，以降低來自洗脫液的背景電導。另外可將樣品離子轉變成相應的酸或堿，以增加其電導。抑制裝置有柱型和離子交換膜管型兩種。
抑制柱內填充與分離柱填料相反電荷的離子交換樹脂。當分析陰離子時，要用苯乙烯系列的強酸型（H+）樹脂裝柱；而分析陽離子時，則用苯乙烯系列的強堿型（OH-）樹脂裝柱。抑制柱須定期再生。
離子交換膜管型抑制系統可解決色譜上出現的水和碳酸離子的負峰。這是一種表面經磺化處理的聚苯乙烯多孔纖維管，管內流過流動相，管外流過再生抑制液，借助于離子交換作用來消除背景離子。
分析陰離子時，Na+穿出纖維管壁進入抑制液(H2SO4)中，與硫酸反應生成硫酸鈉而被除去；同時，H+穿入管壁，與流動相的Na2CO3反應生成H2CO3。若流動相為NaOH時，則生成水。但是，CO32-和SO42-不能穿過管壁，而陽離子卻可穿過。在實際應用中，環境溫度超過40℃時，H2SO4有可能將管膜破壞。為此有人改用十二烷基苯磺酸(Dodecyl Benzene Sulfonic Acid,DBS)作再生抑制液來取代硫酸液。DBS則較為安全，而且這種抑制液能使HCO3-減少而使負峰變得更小，并且通常都出現于同一位置，使色譜的重現性提高，保留時間不變；但會出現F-峰的峰高變低和峰寬增加的問題。有人在膜管內裝填苯乙烯和二乙烯苯的共聚物小球，因而提高了交換效率和色譜峰的銳度，這種改良后的裝置稱為組合型多孔纖維管抑制器，可使負峰現象大大改善，其效果最好。
對于陽離子來說，分離柱裝有陽離子交換填料，抑制單元則為羥基陰離子交換劑，洗脫液中典型的是H+或苯二銨[Ph(NH3)22+]，通過抑制單元后分別轉變為H2O或Ph(NH2)。抑制型離子色譜柱因價格昂貴，使用也較復雜，限制了該裝置和操作的進一步發展。