內源性抗原是指細胞自身合成的抗原，如腫瘤抗原和病毒蛋白抗原等。內源性抗原在細胞內生成后，可被存在于胞質中的蛋白酶體，即小分子聚合多肽體（LMP）降解成小分子多肽；小分子多肽與熱休克蛋白70/90在胞質內結合后，經抗原肽轉運體（TAP）轉運到內質網中，通過加工修飾成為具有免疫原性的抗原肽；抗原肽與內質網中合成的MHCⅠ類分子結合，形成抗原肽-MHCⅠ類分子復合物；后者轉入高爾基體再通過分泌小泡將其運送到APC表面，供相應CD8+T細胞識別結合。
