ANA見于多種自身免疫病（尤其是自身免疫性風濕病）患者，例如全身性紅斑狼瘡（SLE）、藥物誘導的狼瘡、混合性結締組織病的檢出率都可達100%；干燥綜合征（Sjgren綜合征）、進行性全身性硬化癥檢出率可達70%～85%；其他如類風濕性關節炎、多發性肌炎及皮肌炎、慢性活動性肝炎、潰瘍性結腸炎等也有20%～50%的檢出率。此外，橋本甲狀腺炎、重癥肌無力、多發性動脈炎等患者也可能檢出ANA。
