原理
經典的AMA測定法為間接免疫熒光法。大鼠腎的冷凍切片是檢查AMA而定標準細胞抗原片。也可在玻片上包被M2抗原，直接測定抗M2AMA。也可用3種（M2、M4、M9）混合物抗原做免疫印跡，分析相應而定自身抗體；或分別用3種抗原包被微孔反應板，用ELISA法測定抗2、抗M4、抗M9線粒體抗體。
臨床意義
原發性膽汁性肝硬化癥敏感、特異性實驗，高滴度的AMA-M2在原發性膽汁性肝硬化中陽性率>90%。常用作原發性膽汁性肝硬化癥的重要實驗室診斷指標，但AMA與PBC的病期、疾病嚴重程度、治療效果均無相關性。除PBC外，抗線粒體M2型抗體也見于慢性活動性肝炎（CAH）、HBsAg陰性的肝病。由于線粒體抗原成分復雜，對很多抗原的性質尚不了解，而原發性膽汁性肝硬化患者幾乎都出現高效價抗AMA-M2。因此，目前抗AMA-M2測定主要用于PBC的診斷。