DNA的結構轉換和解析
Ⅱ型拓撲異構酶巧妙地執行了打開DNA雙螺旋的過程。它將DNA的一個雙螺旋結構切開，并讓另一個螺旋從缺口處穿過，在此之后一個雙螺旋便被打開。由兩個蛋白構建的：這個編號為1bgw的蛋白具有拓撲異構酶的下半部分結構，另外一個編號為1eil的蛋白來自于一個旋轉酶的結構域，它與拓撲異構酶的上部很相似。拓撲異構酶具有很高的催化活性，它具有一些類似于“門”的結構，控制著DNA進入到其上面的兩個裂口內。 此處用紅色顯示的兩個酪氨酸與DNA鏈相結合并形成共價鍵，并且這種緊密的結合方式直到DNA重新恢復為止。