揭示了多倍化和結構變異對白菜種內分化的影響機制

　　524個白菜品種親緣關系 中國農科院供圖

　　BrPIN3.3中的結構變異與大白菜葉球馴化相關 中國農科院供圖

　　近日，《基因組生物學》（Genome Biology）在線發表了中國農業科學院蔬菜花卉研究所蔬菜分子設計育種創新團隊揭示的多倍化和結構變異對白菜種內分化的影響機制。該研究鑒定了與結球白菜馴化相關的重要候選基因，并獲得了白菜物種豐富的基因組變異。這不僅加深了對葉球形成馴化的認識，還將有助于挖掘更多與重要農藝性狀相關的基因，進一步促進白菜育種研究。

　　論文通訊作者王曉武介紹，白菜是蕓薹屬重要蔬菜，種內多樣性極高。研究基于白菜大規模重測序數據，選擇了代表性大白菜、小白菜、菜心、油用白菜和蕪菁等16份不同類型的白菜資源材料，進行基因組從頭組裝。結合已發表的大白菜和油用白菜參考基因組，構建了由18個代表性材料組成的白菜泛基因組，并通過構建整合結構變異的圖形基因組，鑒定到與大白菜葉球馴化相關的重要候選基因。

　　此外，研究發現白菜種內分化過程中，基因偏向性丟失持續進行，并導致白菜亞基因組優勢在繼續擴大。研究結果表明，除“兩步演化”導致白菜亞基因組優勢形成之外，基因組組成可能是導致亞基因組優勢形成的另一個重要因素。

　　該研究得到了國家自然科學基金、國家重點研究項目計劃和中國農科院科技創新工程的支持。