非淋菌性尿道炎的潛伏期一般為１－３周，發病較緩慢，而且相當部分的患者癥狀不明顯，往往被忽略了，合并淋病時病情易被淋病的癥狀掩蓋，給診治上帶來了很大的困難．
男性：男性患者覺尿道口刺癢，有燒灼感，尿道口紅腫充血＼尿頻＼尿急，有時有輕度排尿困難，如在較長時間不排尿，或晨起時尿道口有水樣或稀薄粘液流出．有時尿道口有一層痂皮似的薄膜＂封口＂，或者內被上有污穢物，有些病人無尿道分泌物或者分泌量很少，需用力擠壓陰莖才有分泌物從尿道口溢出．
女性：女性患者表現為白帶增多，陰道紅腫，子宮頸縻爛或有子宮頸炎并有少量分泌物，有的患者有輕微尿痛而無分泌物，還有些患者有腰疼但無任何其它癥狀．
患非淋菌性尿道炎后應及時治療，如延時機，往往會引起許多并發癥．男性合并附睪炎或前列腺炎的較多．急性附睪炎可自覺單側睪丸疼痛，腫大，發硬，陰囊表面皮破充血．在睪丸出現腫漲時，患者尿道分泌物往往消失，因而常會掩蓋病情．另外男性也可以引起精囊和輸精管炎癥，造成不育癥．女性患非淋性尿道炎常常會陰道炎，盆腔炎，嚴重的還會引起異位，不育癥，而盆腔炎等又可引起腹膜炎，輸卵管積膿和盆腔膿腫．
非特異性尿道炎與淋病一樣，也多發生于青年性旺盛期， 25歲以下占60%。60年代以來非特異性尿道炎發病率驟增，在歐美已超過淋病居性傳播疾患發病率的首位。 80年代美國每年新發生的病例達 300-1000 萬人。
（一）衣原體
答：男性好發于冠狀溝、龜頭、包皮、系帶、尿道口，少數見于陰莖體部，同性戀者可發生于肛周及直腸。女性好發于大小陰唇、陰蒂、肛周、宮頸和陰道，偶見于腋窩、臍窩、乳房等處。尤其易發生于有慢性淋病、白帶多及包皮過長者。除以上部位外，人體的其他部位也可患病，如口腔，足趾間等。
支原體、衣原體的臨床表現
根據許多國家報告，NGU中30%-50%，淋病病人中20% 和性活動強但無尿道炎癥狀的人中0.5% ，以目前常用的培養方法，尿道分泌物可培養出衣原體。女性病人因多數無癥狀或僅表現為白帶增多等婦科癥狀，難以確定其發病率，有人估計女性病人可能為男性的4倍。
衣原體是一種寄附于腺上皮細胞胞漿內的。呈球型，有特殊的生長周期。每個生長周期有兩種發育型。
感染型為原體 (elementary body) 呈球形，大小介于與病毒之間 (300-400mm) 。原體可在細胞外生存，有感染性。當其附著在易感細胞表面時，被細胞吞飲，在細胞內原體變成另一種繁殖型。
繁殖型即始體 (initial body) 始體呈圓形或橢圓形。始體按二分裂方式繁殖，最后始體重新組織成原體，從細胞內釋放出來，再感染其他健康易感細胞。整個生長周期為 72h 。
衣原體分類：
1 、鸚鵡熱衣原體。 2 、沙眼衣原體 (Chlamydia trachomatis)
沙眼衣原體至少有 15 個血清型。 D-K8 種血清型與 NGU 有關。 L1 、 L2 、 L33 個型與性病性淋巴肉芽腫 ( 第四性病 ) 有關。
（二）支原體
1 、分解尿素支原體 (ureaplasma ure-alyticum)
是一種原核微生物。能產生尿素分解酶分解尿素。呈球桿狀。因其缺乏堅硬的細胞膜，故不為青霉素所抑制，四環素、紅霉素、壯觀霉素對之有效。現已從人類泌尿生殖道分離出來
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種支原體，其中分離率較高而與泌尿生殖道疾病有關，是分解尿素支原體，其次是人型支原體。嬰兒或無性交接觸的女性生殖道內找不到分解尿素支原體。而性生活越亂，這種支原體陽性率也越高。
Mc Donald 1982 年報告 587 例急性尿道炎癥狀病人中， 209 例 (36%) 中段尿中分離出分解尿素支原體。
2 、人型支原體 (mycoplasma hominis) 支原體對外界環境抵抗力弱，45 ℃ 15min 即可被殺死。對肥皂、酒精、四環素、紅霉素敏感。
衣原體除致成尿道炎、眼結膜炎外，還可致成其他生殖器官炎癥，如附睪炎、前裂腺炎、宮頸炎、陰道炎、輸卵管炎及盆腔炎等。新生兒通過感染的產道可誘發眼結膜炎、肺炎。男性同性戀者，可患直腸炎及咽炎。