新生兒高血壓分為原發性和繼發性兩種。原發性高血壓找不到明確的病因，占２０％；繼發性高血壓可找到明確的病因，占８０％。原發性高血壓的發病機制不很明確，可能與遺傳、飲食中含鹽量過高、肥胖及自主神經調節功能失調有關。繼發性高血壓的患兒約９０％繼發于腎疾病，如多囊腎病、腎盂積水、中胚層腎瘤、腎發育不良、間質性腎炎；新生兒期少見的原因，包括主動脈縮窄（只有上肢高血壓）、內分泌的因素，如皮膚癬；庫欣綜合征、先天性腎上腺皮質增生癥、甲狀腺毒癥及高鈣血癥等均可引起高血壓。
