明膠、膠原蛋白和水解膠原蛋白并不相同。明膠是膠原在高溫作用下的變性產物，其組成復雜，相對分子質量分布寬，由于高溫造成膠原蛋白變性，膠原分子的3股螺旋結構被破壞，但可能有部分α鏈的螺旋鏈還存在，因此一定濃度的明膠溶液能成凝膠狀。在食品工業、攝影和制藥業中被廣泛應用。據報道，全世界每年生產的明膠產品中，有65%用于食品工業，20%用于照相工業，10%用于制藥工業。水解膠原蛋白是在較高溫度下用蛋白酶水解膠原或明膠得到的，受溫度和酶的雙重作用，使水解膠原蛋白的相對分子質量比明膠更小，由于在較高溫度條件下，蛋白酶對膠原肽鍵的水解是隨機的，使水解得到的蛋白液組成也很復雜，是相對分子質量從幾千到幾萬的蛋白多肽的混合物。由于分子量小，水解膠原蛋白容易降解，所以在營養保健品和日用化學品開發方面擁有一定的市場。水解膠原蛋白可用于生物發酵培養基，也可以作為一種高蛋白飼料營養添加劑替代進口魚粉用于混、配合飼料生產。膠原、明膠和水解膠原蛋白這3種物質雖具有同源性，但在結構和性能上卻有很大的區別。膠原保留特有的天然螺旋結構，在某些方面表現出明顯優于明膠和水解膠原蛋白的性能，如膠原止血海綿止血性能優于明膠海綿，作為澄清劑用的魚膠原如果變性則沉降能力明顯降低。然而，人們對這3種物質的認識常常產生混淆，認為它們具有相同性質，甚至認為它們是同一種物質。 [71-72]
水解膠原蛋白和膠原多肽也并不相同，可以近似認為是宏觀和微觀的關系。膠原蛋白分子經水解后主要形成相對分子量較小的膠原多肽，由于膠原蛋白獨特的三股超螺旋結構，性質十分穩定，一般的加工溫度及短時間加熱都不能使其分解，從而造成其消化吸收較困難，不易被人體充分利用。水解后其吸收利用率可以提高很多，且可以促進食品中的其它蛋白質的吸收。膠原多肽除了肽鏈的兩端含有未縮合的末端羧基和氨基外，在側鏈上還含有Lys的ε-NH2以及Asp和Glu的-COOH。膠原多肽可完全溶解于水（冷水亦可溶解），水溶液低粘度，在60%的高濃度下也有流動性，耐酸堿性能好，在酸、堿存在的情況下均無沉淀；耐高溫性能好，200℃加熱亦無沉淀，同時它還具有良好的吸油性、起泡性和吸水性等。