智能人工氣候箱作為大型試驗儀器，采用的是先進的微電腦可編程控制，可通過人們設定溫度、濕度、光照度等來模擬自然氣候。適用于植物的生長和組織的培養、種子發芽實驗、育苗、微生物的培養等實驗，各控制系統較為精密，因此儀器在使用過程需要注意一些事項，以免不合理操作損壞儀器。
1.智能人工氣候箱應使用40℃以下的清潔水（蒸餾水或純凈水），長期使用時絕對不可用自來水等硬水、臟水；
2.每當水箱脫離底座后，必須將底座上的水倒光，否則會造成不產汽；
3.水箱加水蓋和彈簧閥（出水口）不可漏水以免損壞底座內的電器，或造成不產汽；
4.環境溫度應在1-45℃之間；
5.應水平放置在地上、塑料軟管不可折扁、下垂；
6.使用一段時間后需清洗，但不可用硬物擦刮換能片；
7.內有高壓，非專業人員請勿隨意打開底座內的器件；
8.儲藏時應先清潔干凈，并將儀器置于干燥通風處。
除上述注意情況外，在實際操作過程中，還需要對智能人工氣候箱的濕度有嚴格的要求，因為濕度低種子不易發芽，濕度高又容易爛種，因此在使用人工氣候箱種子催芽的過程中，需要利用設備的調控功能，將箱體中的相對濕度保持在合適的條件下，以滿足種子催芽的需要。另外溫度和光照也是種子發芽的必要條件，而溫度均勻，種子發芽才會整齊，因此一般要求箱內的溫度要均勻，誤差不應超過1℃。