曹務春、賀福初、高福Nature攜手發表基因組重大成果

　　由來自中國的科學家領導的一個國際研究小組，對2014年秋天在塞拉利昂收集的一些埃博拉病毒分離株進行了基因組序列分析，追蹤了埃博拉疫情后期階段這一病毒的多樣性和進化。埃博拉的疫情是在去年的春天首次發現在西非國家幾內亞多地集中爆發，后逐漸蔓延到鄰國。

　　在5月13日的《自然》（Nature）雜志上，研究人員報告稱對去年秋天在塞拉利昂5個地區收集的近200份埃博拉病毒（Ebola virus,EBOV）樣本進行了測序。他們的結果揭示在疫情的這一階段EBOV的多樣性增加——他們利用來追蹤病毒在幾個受累社區個體之間移動的一些新EBOV亞譜系體現了這一點。

　　軍事醫學科學院微生物流行病學研究所所長、病原微生物生物安全國家重點實驗室主任曹務春（Wu-Chun Cao）研究員，中科院微生物所的高福（George F. Gao）院士，和北京蛋白質組研究中心的賀福初（Fu-Chu He）院士是這篇論文的共同通訊作者。

　　曹務春說：“2014 EBOV遺傳多樣性大幅增加，為在塞拉利昂、幾內亞和利比里亞開展廣泛的EBOV監測，以更好地認識病毒的進化以及正在發生的疫情的傳播動力學提供了充足的依據。”

　　研究的作者指出，這些以及其他的研究結果預計將“推動國際努力開發出EBOV疫苗及治療方法。”

　　根據美國疾病控制和預防中心的最新報告，自從西非開始爆發疫情以來，在塞拉利昂、利比里亞和幾內亞疑似及確診的埃博拉病例已超過2.67萬例，死亡人數超過1.1萬人。

　　為了確定這次疫情的源頭以及早期EBOV傳播模式，由哈佛大學和Broad研究所領導的一個研究小組對來自塞拉利昂78名埃博拉患者的病毒分離株進行了基因組測序，這項研究工作發布在去年夏天的《科學》（Science）雜志上。

　　分析結果表明，疫情爆發起源于一個天然EBOV儲存庫中的病毒，其跳躍到了幾內亞的人類身上，隨后傳播給塞拉利昂人。

　　即便如此，自這次分析后的幾個月內，科學家們對于病毒的軌跡便一直知之甚少。

　　在最新的Nature文章中，曹務春、賀福初、高福及同事們以2014年9月下旬到11月中旬，中國移動實驗室測試團隊收集的800多個EBOV陽性血液樣本作為起始展開了研究。

　　從中研究人員測序了175個EBOV分離株的基因組，這些分離株代表了塞拉利昂西部、洛科港（Port Loko）、坎比亞（Kambia）和邦巴利區（Bombali）城市和農村地區的一些病例。

　　與疫情爆發最早階段來自幾內亞和塞拉利昂的測序EBOV分離株進行比較，該研究團隊看到了7月到10月底之間在塞拉利昂傳播的EBOV分離株有遺傳和系統發生多樣性增加的跡象。

　　研究小組發現了與至少7個新EBOV亞譜系相符的一些序列，在一些已經相關的分離株中變異和多樣性逐漸增加。他們說，所有這7種亞譜系似乎都是在2014年8月以后出現，主要是在塞拉利昂西部Waterloo周圍。

　　一組新的譜系也出現在諸如Freetown和Maforki Chiefdom等地方，提供了在疫情流行的不同時期一些地區EBOV傳播動力學的一些新認識。

　　同時，研究小組還檢測了EBOV基因組的替換率，指出病毒進化速率與以往爆發期描述的這一病毒的進化速率以及10月期間繼續擴大的群體規模在同等水平。