質譜儀種類非常多,工作原理和應用范圍也有很大的不同。從應用角度,質譜儀可以分為下面幾類:
有機質譜儀:
由于應用特點不同又分為:
氣相色譜-質譜聯用儀(GC-MS)
在這類儀器中,由于質譜儀工作原理不同,又有氣相色譜-四極質譜儀,氣相色譜 質譜-飛行時間質譜儀,氣相色譜-離子阱質譜儀等。
液相色譜-質譜聯用儀(LC-MS)
同樣,有液相色譜-四級桿質譜儀,液相色譜-離子阱質譜儀,液相色譜-飛行時間質譜儀,以及各種各樣的液相色譜-質譜-質譜聯用儀。
其他有機質譜儀,主要有:
基質輔助激光解吸飛行時間質譜儀(MALDI-TOFMS),傅里葉變換質譜儀(FT-MS)
無機質譜儀,包括:
火花源雙聚焦質譜儀。
感應耦合等離子體質譜儀(ICP-MS)。
二次離子質譜儀(SIMS) ,但以上的分類并不十分嚴謹。因為有些儀器帶有不同附件,具有不同功能。例如,一臺氣相色譜-雙聚焦質譜儀,如果改用快原子轟擊電離源,就不再是氣相色譜-質譜聯用儀,而稱為快原子轟擊質譜儀(FAB MS)。另外,有的質譜儀既可以和氣相色譜相連,又可以和液相色譜相連,因此也不好歸于某一類。在以上各類質譜儀中,數量zui多,用途zui廣的是有機質譜儀。
除上述分類外,還可以從質譜儀所用的質量分析器的不同,把質譜儀分為雙聚焦質譜儀,四級桿質譜儀,飛行時間質譜儀,離子阱質譜儀,傅立葉變換質譜儀等。
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