有機質譜儀
由于應用特點不同又分為：
氣相色譜-質譜聯用儀（GC-MS）在這類儀器中，由于質譜儀工作原理不同，又有氣相色譜-四極質譜儀，氣相色譜-飛行時間質譜儀，氣相色譜-離子阱質譜儀等。
液相色譜-質譜聯用儀（LC-MS）同樣，有液相色譜-四器極質譜儀，液相色譜-離子阱質譜儀，液相色譜-飛行時間質譜儀，以及各種各樣的液相色譜-質譜-質譜聯用儀。
其他有機質譜儀，主要有：基質輔助激光解吸飛行時間質譜儀（MALDI-TOFMS），傅立葉變換質譜儀（FT-MS）
