這一步稍不注意會影響成功性或影響獲得的cDNA的片段分布特點。這一步的操作要小心,尤其要在加入cDNA之前通過反復懸浮和試滴保證柱子能正常工作,cDNA的加入和收集要精力集中。獲得的每一級的cDNA量很少,檢測時帶型很暗,所以要用新鮮做的透明薄膠檢測,根據檢測結果一定要舍棄太短的cDNA(一般400bp以下就不要了,因為短片段太多會嚴重影響后面的連接轉化效果及文庫質量)。