商業
蛋白質工程枯草桿菌蛋白酶廣泛用于商業產品（天然酶很容易被洗滌劑和高溫滅活），也被稱為去污劑，例如，在洗衣和餐具洗滌劑、化妝品、食品加工]護膚軟膏、隱形眼鏡清潔劑，以及用于合成有機化學研究。
職業安全與健康
人們可以通過吸入、吞咽、皮膚接觸和眼神接觸在工作場所接觸枯草桿菌蛋白酶。美國國家職業安全與健康研究所(NIOSH)已將60分鐘內的推薦暴露限值(REL)設定為60ng/m3。
枯草桿菌蛋白酶可引起“酶洗滌劑哮喘”。對枯草桿菌蛋白酶（Alcalase）敏感的人通常也對枯草芽孢桿菌過敏。
