1、細胞治療
細胞移植可以治療由于細胞功能缺陷所引起的各種疾病，如糖尿病；中樞神經系統疾病（帕金森，阿爾莫茨癥）；肝功能衰竭；甲狀腺疾病。
2、異種器官移植
治療性克隆是利用核移植技術將病人的體細胞核移植到去核的卵母細胞中，使其重編程并發育成囊胚，然后再用胚胎干細胞分離技術從克隆囊胚的ICM分離出多能胚胎干細胞（ES）。這種干細胞在遺傳學上和病人完全一致，再定向誘導其分化成病人所需要的體細胞進行移植，以取代和修復患者已喪失功能的細胞、組織或器官，而達到完全治愈。治療性克隆不僅解決移植物與受者間的免疫排斥反應問題，而且可以解決移植物的來源問題。
3、核移植科普圖
1997年底，英國Roslin研究所和PPL公司通過克隆轉基因體細胞，獲得了6只整合neo或neo和F2IX基因綿羊，這標志著核移植介導的轉基因技術成功問世。2000年，英國PPL公司將人AAT基因定點整合到胎兒成纖維細胞的α1原膠原（Procollagen）基因座位，而后用轉基因細胞進行核移植，生產出世界首例基因打靶綿羊，其乳中AAT蛋白含量達到了650mg/L，遠高顯微注射法18mg/L的水平。2004年，臺灣培育帶有治療血友病的“第八凝血因子”的體細胞克隆羊。2005年，這只克隆羊產下一只同樣帶有第八凝血因子的公羊。雖然核移植技術有著廣闊的應用前景，并且已取得了一些進展如體細胞核移植等，但也存在著一些問題。主要包括核移植效率低，動物畸形。這要求研究人員進一步了解核質作用機理，改進培養方式。
到2007年為止，雖然核移植技術的發展較快，然而該技術還存在許多問題，如核移植成功率普遍比較低、重構胚的發育率低、畸形胚的比率高。體外培養的時間過長或培養液的成份可能導致移植胚的流產以及出生后的仔畜很快死亡。基因重組編程的機制尚不清楚，其中MPF、NEBD（核膜破裂）和PCC在基因組重編過程的作用還需闡明。基因印記對核移植重新編程的影響以及基因印記與動物克隆技術的成功及不足有何關系，還不清楚。
2001年我國科學家將牛耳細胞克隆的胚胎移入135頭牛體內，每頭牛移植了兩枚克隆胚胎。從2002年1月8日起，陸續獲取了14頭克隆牛犢。至2003年11月，這批被克隆的牛，存活的只有5頭。
體細胞核移植技術在畜牧業、醫藥衛生，以及其它領域擁有著廣泛的應用前景。