PCR原理很簡單，就是三個步驟的循環么，首先你要在紙上打一個草稿，設計好每個步驟什么溫度，運行多久，然后幾個循環。然后設置程序的時候，其實就是把你設計的步驟輸進去就好了。
循環的概念也很簡單，就是告訴系統，我想讓這三個步驟運行多少遍的意思，SEDI里面內置的是GOTO函數，也就是說，當系統從左到右一步一步走，走到一個步驟如果遇到帶GOTO函數了，系統就要停下來看一下，我下一步去哪？所以GOTO函數要告訴系統回到循環中的哪一步（舉例，如果步驟1是95℃ 30s解鏈的步驟，然后步驟3是75℃延伸的步驟，那就在步驟3里面的GOTO函數設置回步驟1），但是你不能光告訴我回哪，你還得告訴我回幾次吧？總不能每次到你這步都給我打回去，那不是永遠跑不完了么？？所以設置GOTO step1之后，還需要在最下面的框里，告訴我循環多少次，比如35次。
這樣，在第36次系統運行到這個步驟的時候，這個步驟的GOTO函數就會把系統放行到下一個步驟了。至此，這套循環執行完畢。