標準的PCR實驗區
試劑準備區、標本制備區、擴增區、產物分析區、各區配套的緩沖區及公共走廊。臨床基因擴增檢驗實驗室設計的核心問題是如何避免污染。
因此，實驗室的平面布局、空調通風系統設計、氣流控制等都是圍繞這個核心問題進行的。為避免交叉污染，進入各個工作區域必須嚴格遵循單一方向進行，即只能從試劑貯存和準備區→標本制備區→擴增反應混合物配制和擴增區→擴增產物分析區。
四個區域空調通風室內設計參數總結
使用實時熒光PCR儀依據
衛生部辦公廳關于印發《醫療機構臨床基因擴增管理辦法》的通知；醫療機構臨床基因擴增檢驗實驗室工作導則；衛辦醫政發〔2010〕194號。合并：擴增區、擴增產物分析區可合并。
PCR實驗室需要的儀器設備
試劑準備區：冰箱、超凈臺、加樣器、混勻器、天平和離心機等。
標本制備區：生物安全柜、加樣器、離心機、溫育儀、混勻器等。
擴增區：核酸擴增儀、超凈臺、微量加樣器、離心機、可移動紫外燈、配備UPS電源。
分析區：酶標儀、洗板機、加樣器和水浴箱等。
污染的預防與控制
PCR實驗室設計的核心問題是如何避免污染。常見的有以下幾種污染類型：擴增產物的污染；天然基因組DNA的污染；試劑的污染以及標本間的污染。要避免污染，首先應是預防，而不是排除。
PCR實驗室建設相關文件
1.《醫療機構管理條例》
2.《醫療機構臨床實驗室管理辦法》
3.《臨床基因擴增檢驗實驗室管理暫行辦法》
4.《醫療機構臨床基因擴增實驗室管理辦法》