正常成年人的幽門管長0.5-1.0cm,含內環層和外縱層平滑肌，厚約5（3-9）mm.內環肌層較厚，含幽門近端和遠端的兩個肌環；它們在大彎側相互分開，而在小彎側聚合成肌突，呈三角形斜行包繞幽門。外層縱行肌與十二指腸延續，也與內環肌相互交織。成人的幽門肌肥厚主要是內環肌，可以局限于肌突，也可以為彌漫性肥厚，厚度可達1.0-1.5mm.幽門管狹小而延長，達2-4M.幽門粘膜充血、水腫，可呈結節狀。
有學者提出成人幽門肥大是繼發性的，是長期幽門痙攣的結果，或繼發于胃竇炎幽門潰瘍、幽門癌和十二指腸潰瘍等疾病，因為這些疾病患者可有不同程度的幽門肌肥厚。
而較多學者則認為，成人的幽門肥大是原發性的。即晚發的先天性幽門肥大，他仆在嬰兒時實際上有先天性幽門肥厚，但程度較輕，因而末表現明顯癥狀。支持這種意見的證據包括：
①成人肥厚性幽門狹窄患者偶有嬰兒期反復嘔吐病史；
②嬰兒患先天性52厚性幽門狹窄者，其同胞兄妹可有幽門肥厚的x線表現而無幽門梗阻癥狀；
③某些成人肥厚性幽門狹窄癥患者的幽門管粘膜下層可見許多擴張的血管瘤樣血管，提示有先天性疾病；
④嬰兒型和成人型幽門肥厚可以發生于同一家族；
⑤某些患先天性肥厚性幽門狹窄癥的嬰兒，即使不手術治療，癥狀也可緩解。
亦有學者提出這可能是患者的幽門先天缺乏縱行肌而排空不良，致使環行肌過度工作而代償性肥大的緣故。有學者發現，肥厚幽門括約肌內的神經節細胞數量減少或變性。而在另外的實驗則發現，破壞動物幽門肌內的神經節后，可發生非器質性幽門狹窄，但不出現幽門肌肥厚。