多骨性纖維異常增生癥有自限傾向，以下的措施可改善一些臨床癥狀，包括：
1、骨損害的內科治療
（1）降鈣素：降鈣素50～100U或益鈣寧40U隔天或1周2次，肌注，有人認為該藥對骨畸形造成的局限腫脹和骨折刺激神經末梢引起的疼痛有明顯止痛作用，無明顯副作用，因價格昂貴影響長期用藥。
（2）二磷酸鹽制劑：療效各家報道不一，常用的有：
①EHDP（disodium edetate）：每天20mg/kg，口服療程6個月～1年。
②帕米磷酸鹽（pamidronate）：60mg/d，靜脈滴注連用3天，每6個月重復1次。
病人在治療期間無自發性骨折發生，在治療2～3療程后骨痛及步態異常消失，肢體長度無變化，血ALP、尿羥輔氨酸下降，但尚未得到骨受損治愈的放射學及閃爍照相的證實。
以上兩種藥使用也未見明顯副作用（可能與病例觀察太少有關），作用機制尚未明了。
2、骨畸形的外科治療
對于MAS的肢體畸形嚴重者可行截骨矯形術。刮除病灶骨，采用植骨與內固定，術后有可能復發。若病變迅速增長，要警惕惡變為骨纖維肉瘤，其次是骨肉瘤，此時不宜放射治療，以免誘發惡變。
3、性早熟的治療
（1）羥孕酮（MPV）：5～10mg/d，可抑制FSH、LH分泌，使乳房回縮，月經停止，或使陰莖和睪丸縮小，陰毛減少，療效肯定。少數病人有惡心、嘔吐、乏力、嗜睡等副作用，有肝、腎功能不全者慎用。
（2）醋酸甲地孕甲地孕甲地孕酮（danazol，danacrin，達那唑）：能抑制促性腺激素的分泌高潮，不抑制正常體內FSH、LH的基礎水平，療效同上，常用量50mg/次，1～2次/d或酌情調整劑量。副作用為肝臟轉氨酶升高，長期應用需定期檢查肝功能，肝功能不全者禁用大劑量。
（3）甲羥孕酮（depoprovera）：每次100～200mg，肌注，每2～3周1次，作用、療效與MPA類似。
（4）酮康唑：具有抑制腎上腺和性腺類固醇合成的作用。最近來自美國馬里蘭醫療中心的Syed和chalew的報道顯示，他們使用酮康唑200mg,3次/d治療2例MAS的女性性早熟的病人1年后，性早熟得到遏止。副作用是皮膚瘙癢、皮疹，但并不影響使用，肝功能異常停藥后可恢復。
（5）睪酮內酯：能抑制雌激素分泌，促進女孩乳腺成熟。也促進骨的線性生長和骨骼的成熟。對非促性腺激素依賴性性早熟療效肯定。用量為20～40mg/（kg·d）。
（6）他莫昔芬（tamoxifen）：認為最優秀的抗非促性腺激素依賴性性早熟的藥物，該藥能與雌二醇競爭雌激素受體，使雌激素耗竭。用此治療后，青春發育減慢，線性生長下降，當中樞性青春期發育時，給予GnRH類似物治療，生長速度及骨骼成熟維持穩定。用量為10～20mg，2次/d。