家族性高脂蛋白血癥Ⅱb型（FCH）患者并發冠心病的危險性明顯性增加，所以糾正高脂血癥是很有必要的。治療的第1步是采用飲食療法。不過，許多FCH患者單用飲食療法難達到理想的降低血脂的效果，常需要考慮應用藥物治療。
已報道用于治療FCH的藥物有：煙酸、纖維酸類、三羥基三甲基戊二酰輔酶A（HMG-CoA）還原酶抑制劑和魚油。
煙酸類藥物
能抑制VLDL合成，并使LDL生成減少，所以適應于治療家族性高脂蛋白血癥Ⅱb型（FCH），但該類藥物的副作用較多。
纖維酸類衍生物
是治療家族性高脂蛋白血癥Ⅱb型（FCH）較為適合的藥物。該類藥物可顯著地降低VLDL濃度，但降低LDL水平效果并不很明顯。
HMG-CoA還原酶抑制劑
對家族性高脂蛋白血癥Ⅱb型（FCH）具有良好的降脂作用，這類藥物不但能顯著降低血漿膽固醇水平，也能使血漿三酰甘油濃度明顯下降。
魚油
能抑制VLDL的合成,對治療家族性高脂蛋白血癥Ⅱb型（FCH）有一定的作用。此外，魚油還能改善餐后高三酰甘油血癥。不過魚油的治療劑量要求較大，才能獲得有效作用。小劑量魚油（<5g/d=一般無明顯降血脂作用。
膽汁酸螯合劑（樹脂）
如氯貝丁酚不適合用于治療家族性高脂蛋白血癥Ⅱb型（FCH），因為這類藥物使VLDL水平升高，可加重高三酰甘油血癥。