對去羥肌苷和其他配方成分有明顯過敏的患者，禁用去羥肌苷分散片。
1、胰腺炎無論在未接受治療患者，還是曾接受治療患者，也無論免疫抑制的程度，單獨使用或者合用去羥肌苷分散片，均會產生致命或非致命的胰腺炎。若懷疑患者患有胰腺炎，應暫停使用去羥肌苷分散片。一旦確定有胰腺炎，應停止使用去羥肌苷分散片。合用司坦夫定的患者，無論是否同時合用羥基脲，發生胰腺炎的可能性均較大。為了維持生命，必須使用有胰腺毒性的藥物時，建議暫停使用去羥肌苷分散片。有胰腺炎危險因素的患者，盡量避免使用去羥肌苷分散片，一定需要使用時，需格外小心。HIV感染的晚期患者，其發生胰腺炎的可能性高，需密切觀察。腎功能損害的患者，若劑量不作調整也較容易發生胰腺炎。胰腺炎的發生率與劑量有關。在三期研究中發現，若劑量超過推薦劑量，其發生率為1%到10%，而采用推薦劑量時的發生率為1%到7%。小兒研究發現，首次劑量低于300mg/m2/日時，胰腺炎發生率為3%（2/60）；高劑量時，發生率為13%（5/38）。兒童患者出現胰腺炎癥狀或體征時，應暫停使用去羥肌苷分散片。一旦確診有胰腺炎，應停止使用去羥肌苷分散片。
2、乳酸中毒和并有脂肪變性的重度肝腫大單獨使用核苷類藥物或者聯合用藥，包括去羥肌苷和其他抗病毒藥物，均會產生乳酸中毒和并有脂肪變性的肝腫大，甚至會引起死亡。這些情況多發生在女性。肥胖和長期的核苷攝入可能是引起上述情況的危險因素。若患者有患肝臟疾病的危險因素，使用去羥肌苷分散片需謹慎。因這些情況也發生在無危險因素的患者，所以用藥也需注意。臨床上或實驗室檢查一旦出現乳酸中毒或明顯的肝毒性（包括肝腫大和脂肪變性，轉氨酶可能不升高），去羥肌苷分散片治療應暫緩。
3、視網膜改變和視神經炎，在成人和兒童患者中，均有視網膜改變和視神經炎的發生。服用去羥肌苷分散片的患者應定期接受視網膜檢查。