主要表現為全身感染中毒癥狀和中樞神經系統及眼部病變。新生兒的顯性感染多為先天性獲得。將近分娩時感染，嬰兒可數周后出現癥狀。如在胎兒期能得到母體一定數量抗體，則出生后對本病有一定的免疫能力，但仍不足以制止發病，病程多呈遷延性。弓形體可侵犯全身各器官，但以中樞神經系統、眼、淋巴結、心肺、肝脾和骨骼肌為主。主要癥狀如下：
1.全身表現
全身感染多見于新生兒，常見有發熱、貧血、嘔吐、發紺、水腫、斑丘疹、體腔積液、肝脾腫大、黃疸、肺炎、心肌炎、淋巴結腫大及消化系統損害等。往往可迅速死亡。所謂新生兒弓形蟲綜合征的主要表現為貧血、黃疸、肝脾腫大。
2.中樞神經系表現
在胎兒出生后，最多見的表現為中樞神經系統損害，可出現腦積水、腦鈣化和各種腦畸形為主要癥狀。表現腦膜腦炎，常見抽搐、肢體強直、腦神經癱瘓、運動和意識障礙、智力低下等。
3.眼部病變
發生眼球病變者較為多見，最常見表現為脈絡膜視網膜炎，其次為眼肌麻痹、虹膜睫狀體炎、白內障、視神經萎縮，偶爾整個眼球被侵犯，以致眼球變小、畸形及失明。一般發生在兩側眼球。
隱匿型先天性弓形蟲病亦較常見，約占80%，出生時可無癥狀，但在神經系統或脈絡膜視網膜有弓形蟲包囊寄生，而至數月、數年或至成人才出現神經系統或脈絡膜視網膜炎癥狀。