因未進行相關研究，更昔洛韋眼用凝膠與其他眼藥的相互作用尚不明確。當更昔洛韋口服給藥時，藥物相互作用為：
1、地丹諾辛：在口服更昔洛韋眼用凝膠前2小時或同時服用地丹諾辛，可使地丹諾辛穩態AUC0-12增加111±114%。在口服本品前2小時服用地丹諾辛，更昔洛韋的穩態AUC下降21±17%，但兩藥同時使用時更昔洛韋的AUC不受影響，兩種藥物的腎清除率均沒有顯著改變。
2、齊多夫定：當口服更昔洛韋眼用凝膠每次1000mg，每8小時1次和齊多夫定每次100 mg，每4小時1次，更昔洛韋平均穩態AUC0-8 下降17±25%。齊多夫定穩態AUC0-4增加19±27%。由于齊多夫定與更昔洛韋均有可能引起中性粒細胞減少和貧血，一些患者可能不能耐受兩種藥物的全量聯合使用。
3、丙磺舒：當口服本品每次1000mg，每8小時1次和丙磺舒每次500mg，每6小時1次時，更昔洛韋的平均穩態AUC0-8 增加53±91%，腎清除率降低22±20%，這種相互作用與競爭腎小管分泌有關。
4、亞胺培南-西司他丁：同時接受本品和亞胺培南-西司他丁的患者有出現無顯著特點的癲癇發作的報道，故除非潛在獲益超過風險，這些藥物不可同時使用。
5、其他藥物：抑制快速分裂細胞群如骨髓、精原細胞、皮膚生發層和胃腸道粘膜細胞復制的藥物與更昔洛韋合用均可增加毒性。因此，此類藥物如氨苯砜、戊烷脒、5-氟胞嘧啶、長春新堿、長春堿、阿霉素、二性霉素B、甲氧芐氨嘧啶/磺胺甲基異惡唑復合劑或其他核苷類似物僅可在潛在獲益超過風險時與更昔洛韋眼用凝膠同時使用。