(1)氣管鱗狀上皮癌：多發生于氣管的下1/3 段，占原發性氣管惡性腫瘤的40%～50%，可表現為定位明確的突起型病變，亦可為潰瘍型，呈浸潤性生長，易侵犯喉返神經和食管，在氣管內散在的多發性鱗狀上皮癌偶可見到，表面潰瘍型鱗狀上皮癌亦可累及氣管全長。大約1/3 的原發性氣管鱗狀上皮癌病人在初診時已有深部縱隔淋巴結和肺轉移，氣管鱗狀上皮癌的播散常先到鄰近的氣管旁淋巴結，或直接侵犯縱隔結構。發生在氣管近端的腫瘤，有時很難辨明病變來自氣管本身、喉的基底部或是喉部腫瘤侵犯氣管。當腫瘤同時累及氣管和食管時，經支氣管鏡活檢的組織很難從病理形態學上鑒別腫瘤來自氣管或食管。氣管鱗癌的預后差。
(2)氣管腺樣上皮癌：約占氣管惡性腫瘤的10%，體積較小，質硬，壞死少，病人在就診時往往已有腫瘤的深部侵襲，預后差。其他少見的氣管癌還有燕麥細胞癌。起源于氣管間質的惡性腫瘤包括平滑肌肉瘤、軟骨肉瘤、脂肪肉瘤等。氣管的癌肉瘤和軟骨肉瘤通過手術切除有治愈的可能。