法布瑞氏癥因涉及多種不同的系統,需要各科專家聯合診治。目前,此疾病的治療方式除了癥狀治療以外,亦可采用酵素替代療法。在癥狀治療方面,肢體疼痛可藉由一些藥物來緩解,若病情進展到腎衰竭的階段則需靠血液透析以維系生命。在酵素替代療法方面,利用基因工程所合成的法布瑞氏癥酵素制劑,經臨床試驗證實可有效減少醣脂質堆積于某些器官,有助于改善癥狀與減緩長期合并癥。至今,現有的兩種酵素制劑皆已經由衛生署核準為罕見疾病用藥。