一、細胞核
細胞核的改變是細胞壞死的主要形態學標志，主要有三種形式：
①核濃縮（pyknosis），即由于核脫水使染色質濃縮，染色變深，核體積縮小；
②核碎裂（karyorrhexis），核染色質崩解為小碎片，核膜破裂，染色質碎片分散在胞漿內；
③核溶解（karyolysis），在脫氧核糖核酸酶的作用下，染色質的DNA分解，細胞核失去對堿性染料的親和力，因而染色變淡，甚至只能見到核的輪廓。最后，核的輪廓也完全消失。
二、細胞漿
細胞漿嗜酸性染色增強。有時實質細胞壞死后，胞漿水分逐漸喪失，核濃縮而后消失，胞體固縮，胞漿強嗜酸性，形成嗜酸性小體，稱為嗜酸性壞死。實質細胞壞死后，整個細胞可迅速溶解、吸收而消失。
三、間質
在各種溶解酶的作用下，間質的基質崩解，膠原纖維腫脹、崩解、斷裂或液化。壞死的細胞和崩解的間質融合成一片模糊的顆粒狀、無結構的紅染物質。