1.外毒素檢測
（1）生物學方法：操作復雜，且不易獲得敏感動物，動物的個體差異影響結果判斷，只有在發現新毒素的特殊情況下采用。
（2）免疫血清方法：具有快速、靈敏、特異的優點，且可進行大樣品量篩選。有沉淀反應、顆粒吸附凝集試驗（血凝試驗和膠乳凝集試驗）、固相放射免疫試驗、酶聯免疫吸附試驗和免疫印跡試驗。
（3）核酸和基因診斷技術：基因探針技術可檢查單個菌落產生毒素的性質，通常取病原菌染色體或質粒毒素基因片段制備成探針，利用放射性核素或非放射性生物系統標記，以檢查未知標本，不需要培養細菌，操作簡單。
（4）自動化檢測：儀器原理均根據微生物形態、代謝產物和血清學反應設計，包括細胞顆粒計數儀、光散射測定儀、顏色改變濃度儀、薄層掃描儀和熒光光度計等。
2．內毒素檢測
（1）家兔熱原試驗：是將定量的被檢測標本通過耳緣靜脈注入家兔內，觀察家兔注射后體溫變化，判斷是否存在內毒素。
（2）鱟試驗：是目前檢測內毒素最敏感的方法，可檢測量微量的脂多糖（LPS）（0.01～1 ug/ ml）。取少量鱟試劑放于兩支試管中，加入蒸餾水使之溶解，其中一支試管加入少量標準內毒素，另一支加入蒸餾水進行對照，將上述兩支試管輕輕搖勻后，垂直置于37℃溫箱中，1h后觀察有無凝固，發生凝固者為陽性，不凝固者為陰性。