肺吸蟲病是以肺部病變為主的全身性疾病，臨床表現復雜，癥狀輕重與入侵蟲種、受累器官、感染程度、機體反應等多種因素有關。起病多緩慢，因準確感染日期多不自知，故潛伏期難以推斷，長者10余年，短者僅數天，但多數在6～12個月。患者可有低熱、咳嗽、咳爛桃樣痰和血痰、乏力、盜汗、食欲不振、腹痛、腹瀉或蕁麻疹等臨床表現。按其侵犯的主要器官不同，臨床上可分為4型。
1.肺型
肺為衛氏并殖吸蟲最常寄生的部位，癥狀以咳嗽、血痰、胸痛最常見。典型的痰呈果醬樣黏痰，如伴肺部壞死組織則呈爛桃樣血痰。90%患者可反復咯血，經年不斷，痰中或可找到蟲卵。當并殖吸蟲移行入胸腔時，常引起胸痛、滲出性胸腔積液或胸膜肥厚等改變。四川并殖吸蟲感染，咳嗽、血痰少見而胸痛、胸腔積液較多，少數患者可有蕁麻疹或哮喘發作。
2.腹型
腹痛尤以右下腹為多見，輕重不一，亦可有腹瀉、肝大、血便或芝麻醬樣便，在其中或可找到成蟲或蟲卵。里急后重感明顯，體檢腹部壓痛，偶有肝、脾、淋巴結腫大及腹部結節、腫塊或腹水。腹部腫塊捫之似有囊性感，數目不等，直徑1～4cm。四川并殖吸蟲常在肝內形成嗜酸性膿腫，導致肝大及肝功能異常。
3.腦型
常為衛氏并殖吸蟲引起，多見于兒童及青壯年，在流行區其發生率可高達2%～5%。其表現有：顱內壓增高癥狀，如頭痛、嘔吐、意識遲鈍、視盤水腫等，多見于早期患者。腦組織破壞性癥狀，如癱瘓、失語、偏盲、共濟失調等一般在后期出現。刺激性癥狀，如癲癇發作、視幻覺、肢體異常感覺等是病變接近皮質所致。炎癥性癥狀，如畏寒、發熱、頭痛、腦膜刺激征等多見于疾病早期。
4.結節型
以四川并殖吸蟲引起多見，其發生率50%～80%。可發生于腹、胸、背、腹股溝、大腿、陰囊、頭頸、眼眶等部位，黃豆至鴨蛋大。結節為典型嗜酸性肉芽腫，內有夏科氏結晶或可找到蟲體但無蟲卵，約有20%衛氏并殖吸蟲患者可有此征象。結節多位于下腹部及大腿皮下或深部肌肉內，1～6cm大小，孤立或成串存在，結節內有夏科氏結晶、蟲體或蟲卵。