由于發病部位不同，臨床癥狀各不相同。常見的有：
（一）腦蛛網膜炎。
1．后顱凹蛛網膜炎：
（1）背側型：臨床癥狀以顱內壓增高為主，出現頭痛、嘔吐、視乳頭水腫等，并可因慢性枕大孔疝而致枕頸部疼痛、頸項強直。
（2）腹側型：眩暈、眼球震顫、病灶側耳聾、耳鳴、周圍性面癱、顏面感覺減退、角膜反射消失以及肢體共濟失調等。
2．大腦半球凸面蛛網膜炎：主要癥狀為頭痛和癲癇發作。頭痛可為局限性或彌漫性，一般較輕，有時在頭位改變時可有加重。癲癇多為局限性。局限性的神經損害癥狀如偏癱、失語等較少較輕。
3．視交叉蛛網膜炎：以頭痛和視力障礙為主。
（二）脊髓蛛網膜炎。
以胸髓、頸髓病變較多見，早期常為后根刺激癥狀，產生神經根受累區域內的根性疼痛，輕重不一，休息后可減輕，常持續數月數年后出現不同程度的脊髓壓迫癥狀。
（三）腦脊髓蛛網膜炎。
為腦部和脊髓均有病變，兩者可同時發生，或由脊髓病變逐漸至后顱凹顱底所致，產生相應的脊髓和顱神經損害癥狀。