超濾法與平衡透析法相似，也是研究蛋白質與小分子結合作用的常用方法。該方法是在壓力差的驅動下，藥物分子擴散透過半透膜。超濾法的最大優點是實現血漿中游離小分子的快速分離、用時短，與平衡透析法相比，大大提高了分離速率。但該方法也同樣存在Gibbs-Donna效應、非特異性的透析設備表面的藥物吸附效應以及蛋白質泄漏等缺點。由于該方法操作簡單、分析快速以及商品化96孔平衡透析裝置的應用，超濾法可用于藥物篩選，療效追蹤以及臨床藥理與藥效學研究中大規模生物樣品的游離藥物濃度分析和藥物蛋白結合率的測定。
此外，采用超濾法結合高效液相色譜法(HPLC)對冬凌草甲素與大鼠、家兔和健康人血漿的蛋白結合率進行測定。結果表明此法簡便快速、靈敏度高、專屬性好，能夠滿足測試生物樣品的要求。