患慢性疾病者出現動脈栓塞的癥狀時應疑及非感染性心內膜炎。如超聲心動圖提示瓣膜贅生物而無心房粘液瘤,血培養陰性，應作懷疑。診斷要取出栓子，對栓子碎片進行檢查。非感染性心內膜炎與培養陰性的感染性心內膜炎的鑒別可能是困難的，然而這是重要的,因為感染性心內膜炎用抗凝治療的出血發生率高。
非感染性心內膜炎多見于中老年≥50歲者占79.2%但可見于任何年齡組非感染性心內膜炎缺乏特異性的癥狀和體征。聽診對診斷非感染性心內膜炎幫助不大，僅1/3病例可出現心臟雜音，多位于胸骨下緣偶向心尖傳導雜音性質柔和。半數病例可發生栓塞癥狀，如腦栓塞可出現偏癱冠脈栓塞可引起心肌缺血或心肌梗死腎動脈栓塞可產生腎絞痛等等，但由于非細菌性血栓性心內膜炎的贅生物較小因而栓子微小，故極少引起大動脈和中等動脈栓塞多為小動脈栓塞，故多數病例雖有栓塞而無癥狀，因此不少病例生前未能診斷。