University of Texas Southwestern Medical Center at Dallas的分子遺傳學教授Masashi Yanagisawa博士及其同事為新研究的蛋白定名為食欲肽（英語：Orexin），以表明它“開胃”/“促進食欲的”的作用。（英語形容詞：orexigenic）
另一方面，Luis DeLecea, Thomas Kilduff及其同事亦發表這種蛋白的發現，并命名為下丘腦泌素（英語：hypocretins），以表明其源自下丘腦的合成，并同時反映了腸促胰島素（英語：incretin）的相似性。
名稱仍然在爭論中，食欲肽一名備受爭議，原因是有證據表明促進食欲的的效果可能只是伴隨的或微不足道的。另一方面亦有人認為下丘腦泌素的命名是尷尬的，并指出很多神經肽的名稱跟其主要作用也是沒有關系。除非在科學界獲得共識，否則食欲肽跟下丘腦泌素兩個名稱似乎將會繼續在不同的學界發表中出現。