毛細管氣相色譜儀的毛細管柱載氣體積流量比填充柱小得多，將樣品從氣化室沖洗到色譜柱需要較長的時間，導致進樣器內色譜區帶嚴重擴張。此外，柱容量小，采用常規的進樣方式，無法控制這樣小的進樣量。因此采用分流進樣。
由于毛細管氣相色譜儀的毛細管柱載氣體積流量很小，進入檢測器后發生突然減速，引起色譜峰擴張。因此需在毛細管柱出口與檢測器之間安裝輔助尾吹裝置，使組分快速流過檢測器。
