毛細管電泳色譜儀（CE）分析的樣品預濃縮方法有堆積進樣、電場聚焦進樣、等速電泳進樣、固相萃取、液液分配色譜、中空纖維液相微萃取、吸附色譜和親和色譜等。
一、堆積進樣：
1、原理：
根據樣品塞子與CE緩沖液的導電性差異來實現。若樣品的導電性小于CE緩沖液，樣品塞子上的電場強度高于緩沖液，樣品塞子中離子的遷移速度大于緩沖液。若樣品以夾心餅干方式進行CE電泳，則樣品在緩沖液中聚焦濃縮。
2、特點：
可顯著增加樣品的輸出信號，約達20倍。
二、電場聚焦進樣：
1、原理：
電場聚焦進樣類似于樣品堆積進樣，也是根據樣品與CE緩沖液的遷移速度差異來實現，差別是進樣步驟和聚焦過程。電場聚焦進樣是在整個進樣過程都施加電壓，聚焦發生在用緩沖液瓶更換為樣品瓶直到CE電泳開始的一段時間。即電場聚焦進樣是根據樣品的遷移速度與電場強度成正比的特點，在CE電泳初期，使樣品從高電場突然轉入低電場，因減速而堆積在電場交界處，使區帶變窄，濃度提高，而達到聚焦濃縮的目的。
2、特點：
可突破樣品堆積進樣70%毛細管體積的進樣量限制，使樣品濃縮約100倍，但有進樣歧視現象。
三、等速電泳進樣：
等速電泳進樣既是CE的一種電泳模式，又可作為預濃縮的一種方法。采用等速電泳進樣進行樣品預濃縮有耦合毛細管等速進樣和瞬時毛細管等速進樣兩種模式。
1、耦合毛細管等速進樣：
（1）原理：
將兩根毛細管相連接，一根用作等速電泳（ITP），另一根用作CE電泳。
（2）特點：
僅適用于水溶性樣品且裝置復雜，不常用。
2、瞬時毛細管等速進樣：
（1）原理：
用一根毛細管既作ITP電泳，又作CE電泳。
*步，將樣品溶解在前導電解質（通常是氨溶液）中，以壓力進樣方式將樣品導入CE毛細管中。然后將毛細管插入尾隨電解質瓶（通常為醋酸）中，在毛細管兩端施加約30kV電壓，使前導電解質、樣品和尾隨電解質向陰極移動，由于淌度差異，樣品被聚焦在前導電解質和和尾隨電解質之間。
第二步，用前導電解質作為背景電解質進行CE電泳。
（2）特點：
對蛋白質和多肽均可進行分析，發展前景。
四、固相萃取：
1、原理：
固相萃取常用C2、C8和C18作吸附劑，萃取床連接在轉移毛細管和CE之間。樣品通過轉移毛細管進入萃取床，用電泳緩沖液沖洗樣品，隨后注入50～100nL有機修飾劑塞子使樣品洗脫進入CE。有機修飾劑可引起樣品堆積。
2、特點：
可顯著降低檢測下限，但會使分離度降低，譜帶展寬，峰拖尾。
五、液液分配色譜：
1、根據液液分配色譜和電泳進行濃縮：
（1）步驟：
第一步，將樣品溶解在非極性溶劑（如乙酸乙酯）中，以電動進樣方式將樣品導入CE毛細管中。同時，由于液體對流作用，可避免大量乙酸乙酯進入毛細管中。
第二步，將毛細管插入尾隨電解質瓶中，在電場作用下開始聚焦。
第三步，達到穩態后，將毛細管插入前導電解質瓶中進行CE電泳。
（2）特點：
此法濃縮能力高達1000倍，但蛋白質易變性，在非極性相中易沉淀。
2、用一張浸有非極性溶劑（如十一碳烷）的聚丙烯膜將預濃縮室隔成兩個部分：一部分是供相，作為樣品進入相；另一部分是受相，作為富集相。兩相均為水溶性。通過調節兩相pH，使樣品在供相中不帶電荷，進入受相則帶電荷，從而達到濃縮目的。
六、中空纖維液相微萃取：
1、原理：
利用中空纖維壁能選擇性阻止一定分子量的物質通過的特性而達到濃縮目的。
將中空纖維通過Teflon管與CE毛細管相連接，以電動方式進樣，由于蛋白質不能透過中空纖維壁而聚集在毛細管入口端。濃縮完成后，關閉進樣電場，接通分離電場進行CE電泳。
2、特點：
此法速度快，濃縮效率高，可除掉一些小分子物質（如鹽類），對痕量蛋白質的檢測十分有效。
七、吸附色譜：
1、原理：
在CE毛細管進樣端填充一小段吸附色譜填料或涂布一層色譜固定液，使樣品吸附濃集，再進行CE電泳。
2、特點：
此法可提高檢測靈敏度近百倍，但進樣時間長。
八、親和色譜：
1、原理：
將親和色譜柱與CE毛細管相連接，以壓力方式進樣，然后根據樣品性質，以小體積的有機溶劑或特殊緩沖液進行洗脫，進入CE。
2、特點：
此法進樣量可達50μL，濃縮高達100～500倍，可有效地降低檢測下限。