氣液分配色譜儀的色譜柱選定后，需要對色譜柱進行試漏與清洗。
一、色譜柱的試漏：
將色譜柱一端堵住，全部浸入水中，另一端通入氣體，在高于使用時操作壓力下不應有氣泡冒出。否則應更換色譜柱。
二、色譜柱的清洗：
根據柱材料選擇清洗方法。
1、不銹鋼柱：
可用50～100g/L的熱NaOH水溶液抽洗4～5次，以除去柱管內壁的油漬和污物，然后用自來水沖洗至中性，烘干后備用。
2、玻璃柱：
可用洗滌劑浸泡洗滌兩次，再用自來水沖洗至中性，然后用蒸餾水沖洗兩次（洗凈的柱內壁不應掛有水珠），在110℃烘箱中烘干后使用。
3、銅柱：
可用10%的鹽酸溶液浸泡，抽洗，直至抽吸液中沒有銅銹或其它浮雜物，然后用自來水沖洗至中性，烘干后備用。
對于經常使用的柱管，在更換固定相時，倒出原來裝填的固定相后用水清洗，再用丙酮等沖洗2～3次，然后烘干，即可重新裝填新的固定相。