醫用回旋加速器（medical cyclotron）之中用于產生F-18的高能粒子轟擊條件會破壞像脫氧葡萄糖或葡萄糖之類的有機物分子，因此必須首先在回旋加速器之中制備出氟化物形式的放射性F-18。這可以通過采用氘核轟擊氖-20來完成；但在通常情況下，F-18的制備是這樣完成的：采用質子轟擊富O水（O-enriched water，重氧水），導致O之中發生(p,n)核反應（中子脫出，或者說散裂（spallation）），從而產生出具有放射性核素標記的氫氟酸（hydroF-18luoric acid，HF-18）形式的F-18。接著，將這種不斷快速衰變的F-18（18-氟化物，18-F-18luoride）收集起來，并立即在“熱室（hot cell）（放射性同位素化學制備室）”之中，借助于一系列自動的化學反應（親核取代反應或親電取代反應），將其連接到脫氧葡萄糖之上。之后，采取盡可能最快的方式，將經過放射性核素標記的18F-FDG化合物（F-18的衰變限定其半衰期僅為109.8分鐘）迅速運送到使用地點。為了將PET掃描檢查項目的地區覆蓋范圍拓展到那些距離生產這種放射性同位素標記化合物的回旋加速器數百公里之遙的醫學分子影像中心，其中可能還會使用飛機空運服務。
最近，用于制備18F-FDG，備有自屏蔽及便攜式化學工作站的現場式回旋加速器，已經伴隨PET掃描儀落戶到了偏遠醫院。這種技術在未來具有一定的前景，有望避免因為要將18F-FDG從生產地點運送到使用地點而造成的忙亂.。