與其它唑類抗真菌藥相仿，偶有患者服用氟康唑后發生過敏的報道。 某些唑類抗真菌藥包括氟康唑，與心電圖中QT間期延長有關。對使用氟康唑的患者進行上市后安全性監測發現，極少數病例報道有QT間期延長和尖端扭轉型室速。這些報道包括伴有多種復雜的危險因素（如：器質性心臟病、電解質紊亂及可能導致上述情況的合并用藥）的危重病例。 已有潛在引起心律失常病情的患者，應慎用氟康唑。 腎功能不全患者應慎用氟康唑。 氟康唑為CYP2C9 的強效抑制劑和CYP3A4 的中效抑制劑。使用氟康唑治療的患者，如同時使用經CYP2C9 及CYP3A4 代謝且治療窗較窄的藥物時需密切監測