水稻是我國重要的糧食作物。為了提高水稻的產量和品質，開展水稻育種的研究是其中重要的途徑，而在水稻育種研究和功能基因解析中,都需要對水稻表型性狀進行檢測。因此就需要利用水稻考種系統來對水稻表型性狀進行檢測，以篩選出高產、優質、抗逆的水稻品種。
以往傳統的水稻考種主要是采用人工測量的方式“一把尺子、一桿秤”，這種測量方式效率低下、可靠性不高已經遠遠不能滿足現代水稻研究的需求。而水稻考種系統提供了一種全自動、數字化的檢測方式，是一種創新的技術手段。
應用表明，水稻考種系統與人工考種具有比較好的一致性，因此可以替代人工完成水稻考種工作。而與傳統的人工考種相比，水稻考種系統擁有以下幾個創新點：
1、提出了一種快速、自動獲取稻穗穗長的新方法，解決了穗頸節識別、彎曲稻穗測量的難題；
2、提出了一種高精度、自動脫粒的新方法，解決了脫粒殘留、破損等關鍵問題；
3、提出了一種快速、有效獲取谷粒多個參數的新方法，解決了實粒、癟粒識別，谷粒、雜質分割以及參數準確計算等難點。
而隨著科學技術的發展，以及水稻考種系統等研究成果的成功應用，克服了現有考種方式測量效率低、可靠性不高及參數有限的問題，實現了水稻的數字化考種，為水稻考種提供了一種新的技術手段，對于水稻育種和功能基因解析等提供了重要的幫助。目前，水稻考種系統已經成為水稻育種研究的一個有力的科學工具。