河北農業大學最新文章利用SNP芯片獲棉花遺傳育種新進展

　　近日，國際著名學術期刊《Plant Biotechnology Journal》在線發表河北農業大學馬峙英教授棉花遺傳育種課題組題為Genome-wide association study discovered genetic variation and candidate genes of fibre quality traits in Gossypium hirsutum L.的研究論文，文章進一步揭示了陸地棉纖維品質性狀遺傳變異分子基礎。

　　纖維品質的遺傳改良一直是陸地棉的主要育種目標，但要做到品質性狀的精準選擇卻比較困難。因此，深化對表型變異分子遺傳基礎的理解和發掘相關基因就顯得尤為重要。

　　在這篇文章中，馬峙英教授研究團隊在這一領域率先利用高通量單核苷酸多態性(SNP)芯片，采用全基因關聯分析(GWAS)和轉錄組測序等前沿技術，在多年多點環境條件下對719份國內外陸地棉品種進行了表型鑒定和GWAS分析，檢測到46個SNP位點與纖維長度、強度、細度等5個纖維品質主要性狀顯著關聯。這些顯著的SNP位點分布在15條染色體，主要涉及多糖生物合成、信號轉導和蛋白質轉移等方面的612個相關候選基因。在At07和Dt11染色體上存在著較多的纖維品質SNP位點和基因，發現了兩個與纖維長度和強度相關聯的單倍型。

　　此外，將GWAS和轉錄組分析結合，進一步鑒定了163個和120個分別與纖維長度和強度有關的基因，從中篩選到若干尚未報道過的新基因以及19個極具研究價值的候選基因。

　　這些結果對纖維品質遺傳基礎解析提供了新的見解，并為改良陸地棉纖維品質提供了候選SNP標記和基因資源。

　　作者簡介：

　　馬峙英，男，漢族，1958年生，新樂市人。博士，教授，博士生導師，國家教學名師，全國優秀教師，河北省高端人才、省管優秀專家，全國“五一”勞動獎章獲得者。現任河北農業大學副校長，作物遺傳育種國家重點（培育）學科、作物學河北省強勢特色學科學術帶頭人，教育部華北作物種質資源研究與利用重點實驗室、河北省作物種質資源重點實驗室主任，河北省棉花育種首席專家、“巨人計劃”創新創業團隊及領軍人才。擔任中國棉花學會副理事長、中國作物學會常務理事等。30多年來始終在教學、科研、生產第一線，致力于作物遺傳育種教學和棉花育種及分子生物學研究工作。作為農學專家，還組織實施“國家糧食豐產科技工程”河北項目區工作。以第一完成人獲得國家科技進步二等獎2項、省部級一等獎4項。2015年獲得何梁何利基金科學與技術創新獎。育成棉花新品種11個；發明ZL9項；以第1作者或通訊作者在Nat Genet、Nat Biotechnol、Nucl Acids Res、Plant J、Genome、Plant Breed、Plant Cell Rep、PCTOC、Euphytica、BMC Genetics等國際著名刊物發表SCI論文30余篇；出版著作8部；已累計培養研究生100余名。