(1)可應用各種抗病毒制劑如GCV、抗巨細胞病毒的免疫球蛋白制劑、干擾素及轉移因子等。但這些藥物并不能解決根本問題，往往停藥后病毒又潛伏地回升；
(2)最近，美國學者研制出兩種活疫苗，初試后頗見效。一種是由AD169菌株研制成的；另一種是從TOWn菌株制成的，經非腸道給藥后，已明顯表現出有抗巨細胞病毒的效能，CMV抗體升高，導致免疫功能增強。
(3)丙氧鳥苷(ganciclovir DHPG)有防止CMV擴散作用。如與高滴度抗CMV免疫球蛋白合用，可降低骨髓移植的CMV肺炎并發癥死亡率，如果耐丙氧鳥苷的CMV感染可選用磷甲酸鈉，雖能持久地減少CMV擴散，但效果比前者差。
(4)阿昔洛韋(無環鳥苷)及阿糖腺苷治療其他皰疹病毒疾病有效，但對CMV感染起不了作用，但阿昔洛韋的衍生物DHPG(9-鳥嘌苓)在試管中作用較阿昔洛韋強25-50倍，但其副作用也大，中性粒細胞減少是其最主要的副作用，療效及安全性有待進一步研究。