功能性吞咽困難的治療包括藥物和心理兩方面。
1.心理治療
在本病的治療中具有重要作用，包括避免加重本病的刺激因素，消除顧慮，進行必要的心理疏導。
2.藥物治療
（1）小劑量的抗焦慮、抗抑郁藥的試用。
（2）抗反流治療：可選用質子泵抑制劑或H2受體拮抗劑。
3.內鏡下治療
對食管遠端排空延遲和食管下括約肌松弛不全者可行擴張治療。
